Изучение генетических особенностей КРС бурой швицкой породы по STR-маркерам
DOI:
https://doi.org/10.28983/asj.y2021i2pp58-63Ключевые слова:
крупный рогатый скот, бурая швицкая порода, микросателлиты, STR, аллелофонд, биоразнообразиеАннотация
Проведено исследование состояния аллелофонда и генетического разнообразия крупного рогатого скота бурой швицкой породы по STR-маркерам. В выборку входили животные (n = 347) пяти пород: бурая швицкая российской (BSH1) и немецкой (BSH2) селекции, джерсейская (DJ), симментальская (SIM), костромская (KOS) и голштинская (HOLSH). Полиморфизм 11 STR-локусов оценивался на 16-канальном капиллярном генетическом анализаторе ABI3130хl. Было обнаружено 393 аллеля с минимальным значением в группе DJ (54) и максимальным – в группе SIM (84). Общее число аллелей на локус варьировало от 25 (BM1824) до 50 (TGLA122), а среднее число аллелей на локус – от 4,33 (TGLA126) до 8,33 (TGLA122), при среднем числе аллелей по всем локусам 5,95. Эффективное число аллелей на локус варьировало от 2,88 (DJ) до 3,76 (BSH2). Максимальное (4,64) и минимальное (3,73) число информативных аллелей идентифицировано для групп BSH2 и BSH1 соответственно. У всех исследуемых групп, за исключением DJ, уровень наблюдаемой гетерозиготности превышал 0,70. В общей сложности было выявлено 23 приватных аллеля с частотами от 0,005 (SIM) до 0,385 (DJ). Анализ AMOVA показал, что 87 % генетической изменчивости приходится на внутригрупповую изменчивость, а 13 % составляют межгрупповые различия. Анализ структуры популяций показал высокий уровень принадлежности всех групп к собственному кластеру. FCA анализ показал перекрывание мультилокусных генотипов особей групп BSH1, BSH2 и KOS. Полученные нами данные показали, что бурая швицкая порода в России характеризуется высоким уровнем генетического разнообразия.
Скачивания
Библиографические ссылки
Зиновьева Н.А. Попов А.Н. Эрнст Л.К. Методические рекомендации по использованию метода полимеразной цепной реакции в животноводстве. – Дубровицы: ВИЖ, 1998. – 47 с.
Иммуногенетический мониторинг при выведении и совершенствовании типа «Смоленский» бурого швицкого скота в Смоленской области / М.Е. Гонтов [и др.] // Достижения науки и техники АПК. – 2011. – № 3. – С. 54–56.
Породы крупного рогатого скота: справочник / сост. Н.В. Иванова, А.Г. Максимов. – Персиановский: Донской ГАУ, 2019. – 143 с.
Современные методы генетического контроля селекционных процессов и сертификация племенного материала в животноводстве / Н.А. Зиновьева [и др.]. – М.: Учебное пособие, 2008. – 329 с.
Cпектры ISSR-PCR маркеров в оценках популяционно-генетической дифференциации карачаевской лошади в хозяйствах карачаево-черкесской республики / Т.В. Голик [и др.] // Известия ТСХА. – 2018. – № 3. – С. 61–77.
Характеристика аллелофонда локальных пород крупного рогатого скота России по микросателлитным маркерам / В.В. Волкова [и др.] // Генетика и разведение животных. – 2018. – № 1. – С. 3–10.
Характеристика аллелофонда холмогорской породы крупного рогатого скота с использованием STR-маркеров // В.В. Волкова [и др.] // Молочное и мясное скотоводство. – 2019. – № 7. – С. 3–7.
Belkhir K., Borsa P., Chikhi L., Raufaste N., Bonhomme F. GENETIX 4.05, Windows software for population genetics. University of Montpellier II, Montpellier, France, 2004.
Evanno G., Regnaut S., Goudet J. Detecting the number of clusters of individuals using the software STRUCTURE: a simulation study // Molecular Ecology, 2005, No. 14, P. 2611–2620.
Nei M. Genetic distance between populations // American Naturalist. – 1972. – No. 106. – P. 283–392.
Peakall R., Smouse P.E. GenAlEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research-an update // Bioinformatics, 2012, No. 28, Р. 2537–2539.
Pritchard J.K.,Stephens M., Donnelly P. Inference of population structure using multilocus genotype data // Genetics, 2000, No. 155, P. 945–959.
Загрузки
Опубликован
Выпуск
Раздел
Лицензия
Copyright (c) 2021 Аграрный научный журнал
Это произведение доступно по лицензии Creative Commons «Attribution-NonCommercial» («Атрибуция — Некоммерческое использование») 4.0 Всемирная.
