МЕТАГЕНОМНЫЙ АНАЛИЗ ДЛЯ МУЛЬТИПРАЙМЕРНОЙ ПЦР-ИНДИКАЦИИ ВИРУСОВ МЕДОНОСНОЙ ПЧЕЛЫ
DOI:
https://doi.org/10.28983/asj.v0i11.344Ключевые слова:
Apis mellifera L., мультипраймерная ПЦР, вирус мешотчатого расплода, вирус острого паралича, вирус черного маточника, вирус деформации крылаАннотация
Рассмотрено конструирование праймеров для индикации и идентификации возбудителей вирусных заболеваний пчел (мешотчатого расплода, острого паралича, черного маточника, деформации крыла) методом мультипраймерной ПЦР. На основе биоинформационного анализа произведен дизайн олигонуклеотидных затравок. Сконструированные праймеры имели схожие температуры отжига (60 °С), что позволяет проводить индикацию каждого из вирусов при единых условиях ПЦР. С данным комплексом олигонуклеотидных затравок амплифицируется большинство известных штаммов и изолятов указанных вирусов. Нуклеотидные последовательности праймеров и универсального положительного контроля позволяют проводить генетическую идентификацию каждого из представленных биопатогенов в одних и тех же условиях ПЦР в мультипраймерном формате.
Скачивания
Данные скачивания пока недоступны.
Библиографические ссылки
1. Биоинформационный анализ олигонуклеотидов для молекулярно-генетической индикации возбудителей аспергиллеза и аскосфероза пчел / Э.В. Ндайишимийе [и др.] // Ветеринарный врач. – 2015. – № 2. – С. 3–9.
2. Генетическая дифференциация популяций медоносных пчел (Apis mellifera L.) и распространение РНК-содержащих вирусов на фоне эпизоотии клеща Varroa destructor на территории Удмуртии / А.Е. Калашников [и др.] // Сельскохозяйственная биология. – 2013. – № 4. – С. 88–92.
3. Горбунов А.В., Нефедова Н.С. Варрооз медоносной пчелы (Apis mellifera) в Саратовской области // Вестник Саратовского госагроуниверситета им. Н.И. Вавилова. – 2012. – № 7. – С. 18–19.
4. Калашников А.Е., Удина И.Г. Распространение РНК-содержащих пчел у медоносной пчелы (Apis mellifera) в отдельных регионах России // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. – 2017. – Т. 35. – № 1. – С. 31–35.
5. Клиническая и лабораторная диагностика заразных болезней расплода пчел / М.И. Гулюкин [и др.] // Ветеринария. – 2016. – № 4. – С. 25–27.
6. Оценка перспектив развития пчеловодства в Южной провинции Замбии / М.Н. Мукминов [и др.] // Ветеринария. – 2015. – № 10. – С. 49–52.
7. Оценка территории провинции Коппербелт Республики Замбия по уровню полиметаллического загрязнения для ведения пчеловодства / Э.В. Ндайишимийе [и др.] // Российский журнал Проблемы ветеринарной санитарии, гигиены и экологии. – 2015. – № 3(15). – С. 80–84.
8. Основные научные направления и итоги деятельности лаборатории ветеринарной санитарии в пчеловодстве /А.М. Смирнов [и др.] // Российский журнал Проблемы ветеринарной санитарии, гигиены и экологии. – 2015. – № 1(13). – С. 26–31.
9. Поражение медоносной пчелы вирусами и паразитами и состояние пчелиных семей в разных эколого-географических условиях Большого Кавказа / Е.М. Ханбекова [и др.] // Сельскохозяйственная биология. – 2013. – № 6. – С. 43–54.
10. Угрозы распространения вирусных инфекций у пчел (Apis mellifera L.) и роль клеща Varroa destructor в развитии патологий / А.В. Спрыгин [и др.] // Сельскохозяйственная билогия. – 2016. – Т. 51. – № 2. – С. 156–171.
11. Bernardi S., Venturino E. Viral epidemiology of the adult Apis mellifera infested by the Varroa destructor mite // Heliyon, 2016, V. 2(5), 43 рр.
12. Bilalov F., Skrebneva L., Nikitin O., Shuralev E.A., Mukminov M. Seasonal variation in heavy-metal accumulation in honey bees as an indicator of environmental pollution // Research Journal of Pharmaceutical, Biological and Chemical Sciences. – 2015, V. 6(4), P. 215–221.
13. Fujiyuki T., Takeuchi H., Ono M., Ohka S., Sasaki T., Nomoto A., Kubo T. Novel insect picorna-like virus identified in the brains of aggressive worker honeybees // Journal of Virology, 2004, V. 78(3), P. 1093–1100.
14. Reddy K.E., Yoo M.S., Kim Y.H., Kim N.H., Ramya M., Jung H.N., Thao le T.B., Lee H.S., Kang S.W. Homology differences between complete Sacbrood virus genomes from infected Apis mellifera and Apis cerana honeybees in Korea // Virus Genes, 2016, V. 52(2), P. 281–289.
15. Tehel A., Brown M.J., Paxton R.J. Impact of managed honey bee viruses on wild bees // Current Opinion in Virology, 2016, V. 19, P. 16–22.
16. Tsevegmid K., Neumann P., Ya?ez O. The honey bee pathosphere of Mongolia: European viruses in Central Asia // PLOS One, 2016, V. 11(3).
2. Генетическая дифференциация популяций медоносных пчел (Apis mellifera L.) и распространение РНК-содержащих вирусов на фоне эпизоотии клеща Varroa destructor на территории Удмуртии / А.Е. Калашников [и др.] // Сельскохозяйственная биология. – 2013. – № 4. – С. 88–92.
3. Горбунов А.В., Нефедова Н.С. Варрооз медоносной пчелы (Apis mellifera) в Саратовской области // Вестник Саратовского госагроуниверситета им. Н.И. Вавилова. – 2012. – № 7. – С. 18–19.
4. Калашников А.Е., Удина И.Г. Распространение РНК-содержащих пчел у медоносной пчелы (Apis mellifera) в отдельных регионах России // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. – 2017. – Т. 35. – № 1. – С. 31–35.
5. Клиническая и лабораторная диагностика заразных болезней расплода пчел / М.И. Гулюкин [и др.] // Ветеринария. – 2016. – № 4. – С. 25–27.
6. Оценка перспектив развития пчеловодства в Южной провинции Замбии / М.Н. Мукминов [и др.] // Ветеринария. – 2015. – № 10. – С. 49–52.
7. Оценка территории провинции Коппербелт Республики Замбия по уровню полиметаллического загрязнения для ведения пчеловодства / Э.В. Ндайишимийе [и др.] // Российский журнал Проблемы ветеринарной санитарии, гигиены и экологии. – 2015. – № 3(15). – С. 80–84.
8. Основные научные направления и итоги деятельности лаборатории ветеринарной санитарии в пчеловодстве /А.М. Смирнов [и др.] // Российский журнал Проблемы ветеринарной санитарии, гигиены и экологии. – 2015. – № 1(13). – С. 26–31.
9. Поражение медоносной пчелы вирусами и паразитами и состояние пчелиных семей в разных эколого-географических условиях Большого Кавказа / Е.М. Ханбекова [и др.] // Сельскохозяйственная биология. – 2013. – № 6. – С. 43–54.
10. Угрозы распространения вирусных инфекций у пчел (Apis mellifera L.) и роль клеща Varroa destructor в развитии патологий / А.В. Спрыгин [и др.] // Сельскохозяйственная билогия. – 2016. – Т. 51. – № 2. – С. 156–171.
11. Bernardi S., Venturino E. Viral epidemiology of the adult Apis mellifera infested by the Varroa destructor mite // Heliyon, 2016, V. 2(5), 43 рр.
12. Bilalov F., Skrebneva L., Nikitin O., Shuralev E.A., Mukminov M. Seasonal variation in heavy-metal accumulation in honey bees as an indicator of environmental pollution // Research Journal of Pharmaceutical, Biological and Chemical Sciences. – 2015, V. 6(4), P. 215–221.
13. Fujiyuki T., Takeuchi H., Ono M., Ohka S., Sasaki T., Nomoto A., Kubo T. Novel insect picorna-like virus identified in the brains of aggressive worker honeybees // Journal of Virology, 2004, V. 78(3), P. 1093–1100.
14. Reddy K.E., Yoo M.S., Kim Y.H., Kim N.H., Ramya M., Jung H.N., Thao le T.B., Lee H.S., Kang S.W. Homology differences between complete Sacbrood virus genomes from infected Apis mellifera and Apis cerana honeybees in Korea // Virus Genes, 2016, V. 52(2), P. 281–289.
15. Tehel A., Brown M.J., Paxton R.J. Impact of managed honey bee viruses on wild bees // Current Opinion in Virology, 2016, V. 19, P. 16–22.
16. Tsevegmid K., Neumann P., Ya?ez O. The honey bee pathosphere of Mongolia: European viruses in Central Asia // PLOS One, 2016, V. 11(3).
